Les 4 départements (Territoire de Belfort, Doubs, Jura et Haute-Saône) qui composent la région Franche-Comté comptent 438 officines. Les officines qui couvrent la région Franche-Comté correspondent à 2 % des pharmacies françaises. Rapporté à la population locale, il y a en moyenne en Franche-Comté, une pharmacie qui dessert 2679 personnes.